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| （５０音順リストはこちら） |
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| （５０音順リストはこちら） |
（ ）内の数字は掲載本数 |
| 裸子植物 |
| ソテツ科（Cycadaceae） | ソテツ（１１） | ||
| イチョウ科（Ginkgoaceae) | イチョウ１（２５０） | イチョウ２（４６１） | |
| マツ科（Pinaceae) | クロマツ（４７） | アカマツ（６５） | アイグロマツ（１） |
| ゴヨウマツ（３） | ウラジロモミ（３） | モミ（６５） | |
| ヒメバラモミ（２） | ハリモミ（１） | ツガ（９） | |
| ヒマラヤスギ（１） | |||
| スギ科（Taxodiaceae) | スギ１（２８９） | スギ２（２０８） | スギ３（４０４） |
| スギ４（３２１） | スギ５（４２８） | コウヨウザン（４） | |
| コウヤマキ科（Sciadopityaceae) | コウヤマキ（１７） | ||
| ヒノキ科（Cupressaceae) | ビャクシン（３６） | ヒノキ（３８） | サワラ（３８） |
| ネズコ（５） | アスナロ（４） | ヒノキアスナロ（３） | |
| ラクウショウ（３） | セコイア（２） | メタセコイア（２） | |
| マキ科（Podocarpaceae） | イヌマキ（２２） | ナギ（１１） | |
| イチイ科（Taxaceae) | イチイ（１３） | カヤ（１３６） |
| 被子植物 |
| ヤマモモ科（Myricaceae) | ヤマモモ（１７） | ||
| クルミ科（Juglandaceae) | オニグルミ（２） | サワグルミ（２） | |
| ヤナギ科（Salicaceae) | ポプラ（４） | オオバヤナギ（２） | シロヤナギ（１） |
| コゴメヤナギ（４） | シダレヤナギ（７） | タチヤナギ（１） | |
| エゾヤナギ（１） | マルバヤナギ（８） | ||
| カバノキ科（Betulaceae） | ミズメ（１） | アサダ（４） | イヌシデ（７） |
| アカシデ（１） | |||
| ブナ科（Fagaceae) | ブナ（１１） | ウバメガシ（４） | クヌギ（９） |
| アベマキ（９） | カシワ（８） | ミズナラ（８） | |
| コナラ（１５） | ミズコナラ（１） | ナラガシワ（６） | |
| イチイガシ（５７） | アカガシ（２７） | ハナガカシ（２） | |
| ツクバネガシ（１１） | オオツクバネガシ（２） | アラカシ（８） | |
| ウラジロガシ（１２） | シラカシ（１９） | クリ（１９） | |
| スダジイ（３２８） | ツブラジイ（１６） | ||
| ニレ科（Ulmaceae) | ムクノキ（１９９） | エゾエノキ（８） | エノキ（５０） |
| クワノハエノキ（１） | ケヤキ１（２２９） | ケヤキ２（２４４） | |
| ケヤキ３（１８９） | ケヤキ４（２７９） | ハルニレ（９） | |
| クワ科（Moraceae) | ヤマグワ（７） | アコウ（６３） | ガジュマル（１） |
インドボダイジュ（１） |
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| モクレン科（Magnoliaceae） | オガタマノキ（１５） | ホオノキ（５） | ハクモクレン（１） |
| コブシ（４） | ユリノキ（２） | ||
| クスノキ科（Lauraceae) | クスノキ１（４１０） | クスノキ２（４１４） | ヤブニッケイ（１） |
| タブノキ（１３４） | アオガシ（１） | シロダモ（１） | |
| カゴノキ（１６） | |||
| カツラ科（Cercidiphyllaceae) | カツラ（１９９） | ||
| マタタビ科（Actinidiaceae） | サルナシ（１） | ||
| ツバキ科（Theaceae） | ヤブツバキ（９） | ウラクツバキ（２） | サザンカ（４） |
| ハルサザンカ（１） | チャノキ（１） | ヒサカキ（１） | |
| スズカケノキ科（Platanaceae) | プラタナス（２） | ||
| マンサク科（Hamamelidaceae） | イスノキ（６） | フウ（１） | |
| バラ科（Rosaceae) | ウメ（３） | イヌザクラ（３） | バクチノキ（２） |
| エドヒガン（２３２） | オオヒラザクラ（１） | コヒガンザクラ（１） | |
| ソメイヨシノ（３） | オオヤマザクラ（２） | ヤマザクラ（１０） | |
| カリン（２） | リンゴ（１） | オオズミ（１） | |
| ミチノクナシ（４） | ヤマナシ（８） | ||
| マメ科（Leguminosae) | サイカチ（２１） | エンジュ（７） | フジキ（４） |
| ハリエンジュ（２） | フジ（１８） | ||
| ユズリハ科（Daphniphyllaceae） | ユズリハ（１） | ||
| ミカン科（Rutaceae） | ハマセンダン（１） | カラスザンショウ（１） | キハダ（１） |
| センダン科（Meliaceae） | センダン（１８） | ||
| ウルシ科（Anacardiaceae） | チャンチンモドキ（１） | ハゼノキ（６） | |
| カエデ科（Aceraceae) | ハナノキ（２） | イロハモミジ（１３） | ヤマモミジ（１） |
| オオモミジ（２） | イタヤカエデ（６） | トウカエデ（１） | |
| メグスリノキ（３） | |||
| ムクロジ科（Sapindaceae） | モクゲンジ（３） | ムクロジ（２０） | |
| トチノキ科（Hippocastanaceae) | トチノキ（８５） | ||
| モチノキ科（Aquifoliaceae） | クロガネモチ（１２） | モチノキ（８） | タラヨウ（８） |
| ニシキギ科（Celastraceae） | マユミ（３） | ||
| クロウメモドキ科（Rhamnaceae) | ケンポナシ（４） | ナツメ（１） | |
| ホルトノキ科（Elaeocarpaceae) | ホルトノキ（１１） | コバンモチ（１） | |
| シナノキ科（Tiliaceae) | シナノキ（１２） | ボダイジュ（２） | マンシュウボダイジュ（１） |
| ブンゴボダイジュ（１） | オオバボダイジュ（３） | ||
| グミ科（Elaeagnaceae） | ナツグミ（１） | ||
| ミソハギ科（Lythraceae） | サルスベリ（３） | ||
| ミズキ科（Cornaceae） | クマノミズキ（１） | ミズキ（１） | |
| ウコギ科（Araliaceae) | ハリギリ（１１） | ||
| カキノキ科（Ebenaceae） | カキノキ（６） | ||
| モクセイ科（Oleaceae） | ヤチダモ（２） | トネリコ（１） | ヤマトアオダモ（１） |
| ヒイラギ（１６） | ヒイラギモクセイ（２） | シマモクセイ（１） | |
| キンモクセイ（２） | ギンモクセイ（２） | ウスギモクセイ（１） | |
| ムラサキ科（Boraginaceae） | チシャノキ（６） | ||
| スイカズラ科（Caprifoliaceae） | サンゴジュ（１） |
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