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  裸子植物
 ソテツ科(Cycadaceae) ソテツ(12)    
 イチョウ科(Ginkgoaceae) イチョウ1(250) イチョウ2(462)  
 マツ科(Pinaceae) クロマツ(48) アカマツ(65) アイグロマツ(1)
ゴヨウマツ(3) ウラジロモミ(3) モミ(66)
ヒメバラモミ(2) ハリモミ(1) ツガ(9)
ヒマラヤスギ(1)    
 スギ科(Taxodiaceae) スギ1(289) スギ2(208) スギ3(405)
スギ4(321) スギ5(434) コウヨウザン(5)
 コウヤマキ科(Sciadopityaceae) コウヤマキ(17)    
 ヒノキ科(Cupressaceae) ビャクシン(36) ネズミサシ(1) ヒノキ(38)
サワラ(38) ネズコ(6) アスナロ(4)
ヒノキアスナロ(3) ラクウショウ(3) セコイア(2)
メタセコイア(2)    
 マキ科(Podocarpaceae) イヌマキ(22) ナギ(11)  
 イチイ科(Taxaceae) イチイ(13) カヤ(137)  
  被子植物
 ヤマモモ科(Myricaceae) ヤマモモ(17)    
 クルミ科(Juglandaceae) オニグルミ(2) サワグルミ(2)  
 ヤナギ科(Salicaceae) ポプラ(5) オオバヤナギ(2) シロヤナギ(2)
コゴメヤナギ(4) シダレヤナギ(7) タチヤナギ(1)
マルバヤナギ(8)    
 カバノキ科(Betulaceae) ミズメ(1) アサダ(4) イヌシデ(7)
アカシデ(1)    
 ブナ科(Fagaceae) ブナ(13) ウバメガシ(4) クヌギ(9)
アベマキ(9) カシワ(8) ミズナラ(9)
コナラ(15) ミズコナラ(1) ナラガシワ(6)
イチイガシ(62) アカガシ(27) ハナガカシ(2)
ツクバネガシ(11) オオツクバネガシ(2) アラカシ(8)
ウラジロガシ(12) シラカシ(19) クリ(20)
スダジイ(329) ツブラジイ(16)  
 ニレ科(Ulmaceae) ムクノキ(200) エゾエノキ(8) エノキ(51)
クワノハエノキ(1) ケヤキ1(229) ケヤキ2(245)
ケヤキ3(193) ケヤキ4(289) ハルニレ(9)
 クワ科(Moraceae) ヤマグワ(8) アコウ(63) ガジュマル(1)
インドボダイジュ(1)    
 モクレン科(Magnoliaceae) オガタマノキ(15) ホオノキ(5) ハクモクレン(1)
コブシ(6) ユリノキ(2)  
 クスノキ科(Lauraceae) クスノキ1(410) クスノキ2(420) ヤブニッケイ(1)
タブノキ(136) アオガシ(1) シロダモ(1)
カゴノキ(16)    
 カツラ科(Cercidiphyllaceae) カツラ(203)    
 マタタビ科(Actinidiaceae) サルナシ(1)    
 ツバキ科(Theaceae) ヤブツバキ(10) ウラクツバキ(2) サザンカ(4)
ハルサザンカ(1) チャノキ(1) ヒサカキ(1)
 スズカケノキ科(Platanaceae) プラタナス(2)    
 マンサク科(Hamamelidaceae) イスノキ(6) フウ(1)  
 バラ科(Rosaceae) ウメ(3) イヌザクラ(3) バクチノキ(2)
エドヒガン(278) オオヒラザクラ(1) コヒガンザクラ(1)
ソメイヨシノ(5) オオシマザクラ(1) オオヤマザクラ(2)
カスミサクラ(2) ヤマザクラ(14) カリン(2)
リンゴ(1) オオズミ(1) ミチノクナシ(4)
ヤマナシ(8)    
 マメ科(Leguminosae) サイカチ(21) エンジュ(7) フジキ(4)
ハリエンジュ(2) フジ(18)  
 ユズリハ科(Daphniphyllaceae) ユズリハ(1)    
 ミカン科(Rutaceae) ハマセンダン(1) カラスザンショウ(1) キハダ(1)
 センダン科(Meliaceae) センダン(19)    
 ウルシ科(Anacardiaceae) チャンチンモドキ(1) ハゼノキ(6)  
 カエデ科(Aceraceae) ハナノキ(3) イロハモミジ(13) ヤマモミジ(1)
オオモミジ(2) イタヤカエデ(6) トウカエデ(1)
メグスリノキ(3)    
 ムクロジ科(Sapindaceae) モクゲンジ(3) ムクロジ(20)  
 トチノキ科(Hippocastanaceae) トチノキ(86)    
 モチノキ科(Aquifoliaceae) クロガネモチ(12) モチノキ(8) タラヨウ(8)
 ニシキギ科(Celastraceae) マユミ(3)    
 クロウメモドキ科(Rhamnaceae) ケンポナシ(4) ナツメ(1)  
 ホルトノキ科(Elaeocarpaceae) ホルトノキ(11) コバンモチ(1)  
 シナノキ科(Tiliaceae) シナノキ(12) ボダイジュ(2) マンシュウボダイジュ(1)
ブンゴボダイジュ(1) オオバボダイジュ(3)  
 グミ科(Elaeagnaceae) ナツグミ(1)    
 ミソハギ科(Lythraceae) サルスベリ(3)    
 ミズキ科(Cornaceae) クマノミズキ(1) ミズキ(1)  
 ウコギ科(Araliaceae) ハリギリ(11)    
 カキノキ科(Ebenaceae) カキノキ(6)    
 モクセイ科(Oleaceae) ヤチダモ(2) トネリコ(1) ヤマトアオダモ(1)
ヒイラギ(18) ヒイラギモクセイ(2) シマモクセイ(1)
キンモクセイ(2) ギンモクセイ(2) ウスギモクセイ(1)
 ムラサキ科(Boraginaceae) チシャノキ(6)    
 スイカズラ科(Caprifoliaceae) サンゴジュ(1)